28 Thèmes et Palettes

Ce chapitre a été réalisé dans le cadre d’une collaboration communautaire crée par ar3879

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28.1 Vue d’ensemble

Nos graphiques doivent non seulement être informatifs mais aussi esthétiques pour obtenir l’attention de notre public. Les thèmes et les couleurs utilisées ont un rôle important à jouer quant à l’esthétique des graphiques.

Cette section explique comment utiliser différentes palettes et thèmes selon le contexte et comment rendre nos graphiques cools.

28.2 Thèmes ggplot2

ggplot2 offre un ensemble de thème que nous pouvons choisir pour nos graphiques. Vous trouverez ci-dessous une brève description de chacun:

• theme_gray(): thème signature de ggplot2
• theme_bw(): thème noir et blanc de ggplot2
• theme_linedraw(): lignes noires sur fond blanc uniquement
• theme_light(): similaire à linedraw() mais avec des lignes grises également
• theme_dark(): lignes sur un fond foncé plutôt que clair
• theme_minimal(): pas d’annotations sur le fond du graphique
• theme_classic(): thème sans grillage
• theme_void(): thème vide sans aucun élément

28.2.1 exemples de thèmes ggplot

q <- ggplot(subset, aes(x = clarity, y = carat, color = cut)) +
  geom_point(size = 2.5,alpha = 0.75) 

q + theme_minimal()

Il y a plusieurs autres packages disponibles qui permettent de modifier les thèmes et couleurs de plusieurs façons différentes. Nous discuterons 4 d’entre-eux.

1. RColorBrewer
2. ggthemes
3. ggthemr
4. ggsci

28.3 RColorBrewer

Souvent, on cherche des couleurs qui rendront notre graphique clair et cool.

RColorBrewer offre une multitude de palettes que nous pouvons utiliser en fonction du contexte de notre graphique. Il y a trois catégories de palettes: Sequential, Diverging et Qualitative.

q <- ggplot(subset, aes(x = clarity, y = carat, color = cut)) +
  geom_point(size = 2.5, alpha = 0.75) 

• Sequential Palette: Cette palette représente la nuance de la couleur, de clair à foncé. On l’utilise en général pour représenter un interval de données pour lequel les valeurs basses seront représentées par une couleur claire et les valeurs élevées par une couleur foncée. On citera comme exemples: Blues, BuPu, YlGn, Reds, OrRd.

q + scale_colour_brewer(palette = "Blues")

• Diverging Palette: Cette palette présente trois couleurs ou plus qui divergent totalement (par exemple du bleu, du blanc et du rouge) pour permettre d’établir des contrastes entre données plus facilement. On citera par exemple:Spectral, RdGy, PuOr

q + scale_colour_brewer(palette = "PuOr")

• Qualitative Palette: Cette palette est généralement utilisée lorsque l’on veut souligner les différences entre classes de variables (variables catégorielles). On citera par exemple: set1, set2, set3, pastel1, pastel2 , dark2.

q + scale_colour_brewer(palette = "Pastel1")

28.4 ggthemes

ggthemes élargit le choix de geoms, scales et thèmes de ggplot2. Certains sont vraiment très sympas! On peut changer le thème et la couleur du graphique en fonction du contexte.

g1 <- ggplot(subset, aes(x = clarity, y = carat, color = cut)) +
  geom_point(size = 2.5,alpha = 0.75) 

28.4.1 exemples de ggthemes

g1 + theme_economist() + scale_colour_economist()

g1 + theme_igray() + scale_colour_tableau()

g1 + theme_wsj() + scale_color_wsj()

g1 + theme_igray() + scale_colour_colorblind()

Si on veut utiliser ces couleurs dans nos graphiques mais qu’il n’est pas possible d’utiliser ggthemes, on peut utiliser le package scales pour trouver quelles couleurs ont été utilisées dans une palette donnée. Par exemple:

show_col(colorblind_pal()(6))

28.5 ggthemr

ggthemr est utilisé pour déterminer le thème des graphiques ggplot. Il y a 17 thèmes différents pour changer la façon de présenter un graphique ggplot. L’utilisation de ggthemr est cependant différente des autres packages: on décide du thème avant de l’utiliser.

28.5.1 exemples ggthemr

ggthemr("sky")

## Warning: New theme missing the following elements: axis.ticks.length.x,
## axis.ticks.length.x.top, axis.ticks.length.x.bottom, axis.ticks.length.y,
## axis.ticks.length.y.left, axis.ticks.length.y.right, plot.title.position,
## plot.caption.position

ggplot(subset, aes(x = clarity, y = carat, color = cut)) +
  geom_point(size = 2.5, alpha = 0.75)

ggthemr("flat")

## Warning: New theme missing the following elements: axis.ticks.length.x,
## axis.ticks.length.x.top, axis.ticks.length.x.bottom, axis.ticks.length.y,
## axis.ticks.length.y.left, axis.ticks.length.y.right, plot.title.position,
## plot.caption.position

ggplot(subset, aes(x = clarity, y = carat, color = cut)) +
  geom_point(size = 2.5, alpha = 0.75)

On peut également définir plus de paramètres pour changer les thèmes:

ggthemr("lilac", type = "outer", layout = "scientific", spacing = 2)

## Warning: New theme missing the following elements: axis.ticks.length.x,
## axis.ticks.length.x.top, axis.ticks.length.x.bottom, axis.ticks.length.y,
## axis.ticks.length.y.left, axis.ticks.length.y.right, plot.title.position,
## plot.caption.position

ggplot(subset, aes(x = clarity, y = carat, color = cut)) +
  geom_point(size = 2.5, alpha = 0.75)

28.6 ggsci

ggsci offers a number of palettes inspired by colors used in scientific journals, science fiction movies, and TV shows. For continous data, scale_fill_material(colname) is used, and for discrete data, scale_color_palname() or scale_fill_palname() are used.

ggsci offrent un nombre de palettes inspirées de couleurs utilisées dans les journaux scientifiques, films de science fiction et séries télévisées. Pour des données continues, on utilise scale_fill_material() et pour des données discères, scale_color_palname() ou scale_fill_palname() sont utilisées.

28.6.1 ggsci pour données discrètes

# we need to remove the theme set previously if we don't want to use it anymore
ggthemr_reset()

g1 <- ggplot(subset, aes(x = clarity, y = carat, color = cut)) +
  geom_point(size = 2.5, alpha = 0.75)

g1 + scale_color_startrek()

g1 + scale_color_jama()

g1 + scale_color_locuszoom()

28.6.2 ggsci pour données continues

ggplot(diamonds, aes(carat, price)) +
  geom_hex(bins = 20, color = "red") +
  scale_fill_material("orange")

On peut aussi retrouver la couleur utilisée afin de la réutiliser dans d’autres graphiques créés avec base R:

palette = pal_lancet("lanonc", alpha = 0.7)(9)
show_col(palette)

28.7 Ressources externes

• RColorBrewer: Setting up Color Palettes in R
• ggthemes: Github page containing more examples
• ggthemr: Github Repository of the package
• ggsci: Scientific Journal and Sci-Fi Themed Color Palettes for ggplot2

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